Al ejecutar un merge y luego ejecutar el commit, nos daba un error extraño, era como si el commit se quedase a medias. Al parecer era un error no con SVN sino con SAMBA. Encontré la respuesta con el Sr.Google.
[webroot]
comment = webroot
path = /webroot
public = yes
writable = yes
guest ok = yes
browsable = yes
create mask = 0644
force create mode = 0600
security mask = 0555
force security mode = 0600
Reinicié Samba y se pudo hacer el commit sin problemas.